James Moger
2012-10-30 abcb146f0c4e5c99e5e44349a65e6fd49e9296d9
src/com/gitblit/GitBlit.java
@@ -22,14 +22,18 @@
import java.io.InputStream;
import java.io.InputStreamReader;
import java.lang.reflect.Field;
import java.net.URI;
import java.net.URISyntaxException;
import java.text.MessageFormat;
import java.text.SimpleDateFormat;
import java.util.ArrayList;
import java.util.Arrays;
import java.util.Calendar;
import java.util.Collection;
import java.util.Collections;
import java.util.Date;
import java.util.HashMap;
import java.util.HashSet;
import java.util.LinkedHashMap;
import java.util.LinkedHashSet;
import java.util.List;
@@ -37,12 +41,14 @@
import java.util.Map.Entry;
import java.util.Set;
import java.util.TimeZone;
import java.util.TreeMap;
import java.util.TreeSet;
import java.util.concurrent.ConcurrentHashMap;
import java.util.concurrent.Executors;
import java.util.concurrent.ScheduledExecutorService;
import java.util.concurrent.TimeUnit;
import java.util.concurrent.atomic.AtomicInteger;
import java.util.concurrent.atomic.AtomicReference;
import javax.mail.Message;
import javax.mail.MessagingException;
@@ -50,32 +56,38 @@
import javax.servlet.ServletContextEvent;
import javax.servlet.ServletContextListener;
import javax.servlet.http.Cookie;
import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
import org.apache.wicket.protocol.http.WebResponse;
import org.eclipse.jgit.errors.RepositoryNotFoundException;
import org.apache.wicket.resource.ContextRelativeResource;
import org.apache.wicket.util.resource.ResourceStreamNotFoundException;
import org.eclipse.jgit.lib.Repository;
import org.eclipse.jgit.lib.RepositoryCache;
import org.eclipse.jgit.lib.RepositoryCache.FileKey;
import org.eclipse.jgit.lib.StoredConfig;
import org.eclipse.jgit.storage.file.FileBasedConfig;
import org.eclipse.jgit.storage.file.WindowCache;
import org.eclipse.jgit.storage.file.WindowCacheConfig;
import org.eclipse.jgit.transport.ServiceMayNotContinueException;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.FileResolver;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.RepositoryResolver;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.ServiceNotAuthorizedException;
import org.eclipse.jgit.transport.resolver.ServiceNotEnabledException;
import org.eclipse.jgit.util.FS;
import org.eclipse.jgit.util.FileUtils;
import org.slf4j.Logger;
import org.slf4j.LoggerFactory;
import com.gitblit.Constants.AccessPermission;
import com.gitblit.Constants.AccessRestrictionType;
import com.gitblit.Constants.AuthorizationControl;
import com.gitblit.Constants.FederationRequest;
import com.gitblit.Constants.FederationStrategy;
import com.gitblit.Constants.FederationToken;
import com.gitblit.Constants.PermissionType;
import com.gitblit.Constants.RegistrantType;
import com.gitblit.models.FederationModel;
import com.gitblit.models.FederationProposal;
import com.gitblit.models.FederationSet;
import com.gitblit.models.ForkModel;
import com.gitblit.models.Metric;
import com.gitblit.models.ProjectModel;
import com.gitblit.models.RegistrantAccessPermission;
import com.gitblit.models.RepositoryModel;
import com.gitblit.models.SearchResult;
import com.gitblit.models.ServerSettings;
@@ -85,12 +97,16 @@
import com.gitblit.models.UserModel;
import com.gitblit.utils.ArrayUtils;
import com.gitblit.utils.ByteFormat;
import com.gitblit.utils.ContainerUtils;
import com.gitblit.utils.DeepCopier;
import com.gitblit.utils.FederationUtils;
import com.gitblit.utils.JGitUtils;
import com.gitblit.utils.JsonUtils;
import com.gitblit.utils.MetricUtils;
import com.gitblit.utils.ObjectCache;
import com.gitblit.utils.StringUtils;
import com.gitblit.utils.TimeUtils;
import com.gitblit.wicket.WicketUtils;
/**
 * GitBlit is the servlet context listener singleton that acts as the core for
@@ -124,8 +140,12 @@
   private final ObjectCache<Long> repositorySizeCache = new ObjectCache<Long>();
   private final ObjectCache<List<Metric>> repositoryMetricsCache = new ObjectCache<List<Metric>>();
   private RepositoryResolver<Void> repositoryResolver;
   private final Map<String, RepositoryModel> repositoryListCache = new ConcurrentHashMap<String, RepositoryModel>();
   private final Map<String, ProjectModel> projectCache = new ConcurrentHashMap<String, ProjectModel>();
   private final AtomicReference<String> repositoryListSettingsChecksum = new AtomicReference<String>("");
   private ServletContext servletContext;
@@ -143,13 +163,22 @@
   
   private LuceneExecutor luceneExecutor;
   
   private GCExecutor gcExecutor;
   private TimeZone timezone;
   private FileBasedConfig projectConfigs;
   public GitBlit() {
      if (gitblit == null) {
         // set the static singleton reference
         gitblit = this;
      }
   }
   public GitBlit(final IUserService userService) {
      this.userService = userService;
      gitblit = this;
   }
   /**
@@ -226,6 +255,34 @@
    */
   public static int getInteger(String key, int defaultValue) {
      return self().settings.getInteger(key, defaultValue);
   }
   /**
    * Returns the value in bytes for the specified key. If the key does not
    * exist or the value for the key can not be interpreted as an integer, the
    * defaultValue is returned.
    *
    * @see IStoredSettings.getFilesize(String key, int defaultValue)
    * @param key
    * @param defaultValue
    * @return key value or defaultValue
    */
   public static int getFilesize(String key, int defaultValue) {
      return self().settings.getFilesize(key, defaultValue);
   }
   /**
    * Returns the value in bytes for the specified key. If the key does not
    * exist or the value for the key can not be interpreted as a long, the
    * defaultValue is returned.
    *
    * @see IStoredSettings.getFilesize(String key, long defaultValue)
    * @param key
    * @param defaultValue
    * @return key value or defaultValue
    */
   public static long getFilesize(String key, long defaultValue) {
      return self().settings.getFilesize(key, defaultValue);
   }
   /**
@@ -497,6 +554,28 @@
   }
   /**
    * Authenticate a user based on HTTP request paramters.
    * This method is inteded to be used as fallback when other
    * means of authentication are failing (username / password or cookies).
    * @param httpRequest
    * @return a user object or null
    */
   public UserModel authenticate(HttpServletRequest httpRequest) {
      return null;
   }
   /**
    * Open a file resource using the Servlet container.
    * @param file to open
    * @return InputStream of the opened file
    * @throws ResourceStreamNotFoundException
    */
   public InputStream getResourceAsStream(String file) throws ResourceStreamNotFoundException {
      ContextRelativeResource res = WicketUtils.getResource(file);
      return res.getResourceStream().getInputStream();
   }
   /**
    * Sets a cookie for the specified user.
    * 
    * @param response
@@ -586,12 +665,70 @@
   }
   /**
    * Returns the list of all users who are allowed to bypass the access
    * restriction placed on the specified repository.
    * Returns the list of users and their access permissions for the specified repository.
    *
    * @param repository
    * @return a list of User-AccessPermission tuples
    */
   public List<RegistrantAccessPermission> getUserAccessPermissions(RepositoryModel repository) {
      Set<RegistrantAccessPermission> permissions = new LinkedHashSet<RegistrantAccessPermission>();
      if (!StringUtils.isEmpty(repository.owner)) {
         UserModel owner = userService.getUserModel(repository.owner);
         if (owner != null) {
            permissions.add(new RegistrantAccessPermission(owner.username, AccessPermission.REWIND, PermissionType.OWNER, RegistrantType.USER, false));
         }
      }
      if (repository.isPersonalRepository()) {
         UserModel owner = userService.getUserModel(repository.projectPath.substring(1));
         if (owner != null) {
            permissions.add(new RegistrantAccessPermission(owner.username, AccessPermission.REWIND, PermissionType.OWNER, RegistrantType.USER, false));
         }
      }
      for (String user : userService.getUsernamesForRepositoryRole(repository.name)) {
         UserModel model = userService.getUserModel(user);
         AccessPermission ap = model.getRepositoryPermission(repository);
         PermissionType pType = PermissionType.REGEX;
         boolean editable = false;
         if (repository.isOwner(model.username)) {
            pType = PermissionType.OWNER;
         } else if (repository.isUsersPersonalRepository(model.username)) {
            pType = PermissionType.OWNER;
         } else if (model.hasExplicitRepositoryPermission(repository.name)) {
            pType = PermissionType.EXPLICIT;
            editable = true;
         }
         permissions.add(new RegistrantAccessPermission(user, ap, pType, RegistrantType.USER, editable));
      }
      return new ArrayList<RegistrantAccessPermission>(permissions);
   }
   /**
    * Sets the access permissions to the specified repository for the specified users.
    *
    * @param repository
    * @param permissions
    * @return true if the user models have been updated
    */
   public boolean setUserAccessPermissions(RepositoryModel repository, Collection<RegistrantAccessPermission> permissions) {
      List<UserModel> users = new ArrayList<UserModel>();
      for (RegistrantAccessPermission up : permissions) {
         if (up.isEditable) {
            // only set editable defined permissions
            UserModel user = userService.getUserModel(up.registrant);
            user.setRepositoryPermission(repository.name, up.permission);
            users.add(user);
         }
      }
      return userService.updateUserModels(users);
   }
   /**
    * Returns the list of all users who have an explicit access permission
    * for the specified repository.
    * 
    * @see IUserService.getUsernamesForRepositoryRole(String)
    * @param repository
    * @return list of all usernames that can bypass the access restriction
    * @return list of all usernames that have an access permission for the repository
    */
   public List<String> getRepositoryUsers(RepositoryModel repository) {
      return userService.getUsernamesForRepositoryRole(repository.name);
@@ -606,8 +743,11 @@
    * @param usernames
    * @return true if successful
    */
   @Deprecated
   public boolean setRepositoryUsers(RepositoryModel repository, List<String> repositoryUsers) {
      return userService.setUsernamesForRepositoryRole(repository.name, repositoryUsers);
      // rejects all changes since 1.2.0 because this would elevate
      // all discrete access permissions to RW+
      return false;
   }
   /**
@@ -627,6 +767,22 @@
            throw new GitBlitException(MessageFormat.format(
                  "Failed to rename ''{0}'' because ''{1}'' already exists.", username,
                  user.username));
         }
         // rename repositories and owner fields for all repositories
         for (RepositoryModel model : getRepositoryModels(user)) {
            if (model.isUsersPersonalRepository(username)) {
               // personal repository
               model.owner = user.username;
               String oldRepositoryName = model.name;
               model.name = "~" + user.username + model.name.substring(model.projectPath.length());
               model.projectPath = "~" + user.username;
               updateRepositoryModel(oldRepositoryName, model, false);
            } else if (model.isOwner(username)) {
               // common/shared repo
               model.owner = user.username;
               updateRepositoryModel(model.name, model, false);
            }
         }
      }
      if (!userService.updateUserModel(username, user)) {
@@ -665,14 +821,56 @@
   public TeamModel getTeamModel(String teamname) {
      return userService.getTeamModel(teamname);
   }
   /**
    * Returns the list of all teams who are allowed to bypass the access
    * restriction placed on the specified repository.
    * Returns the list of teams and their access permissions for the specified repository.
    *
    * @param repository
    * @return a list of Team-AccessPermission tuples
    */
   public List<RegistrantAccessPermission> getTeamAccessPermissions(RepositoryModel repository) {
      List<RegistrantAccessPermission> permissions = new ArrayList<RegistrantAccessPermission>();
      for (String team : userService.getTeamnamesForRepositoryRole(repository.name)) {
         TeamModel model = userService.getTeamModel(team);
         AccessPermission ap = model.getRepositoryPermission(repository);
         PermissionType pType = PermissionType.REGEX;
         boolean editable = false;
         if (model.hasExplicitRepositoryPermission(repository.name)) {
            pType = PermissionType.EXPLICIT;
            editable = true;
         }
         permissions.add(new RegistrantAccessPermission(team, ap, pType, RegistrantType.TEAM, editable));
      }
      return permissions;
   }
   /**
    * Sets the access permissions to the specified repository for the specified teams.
    *
    * @param repository
    * @param permissions
    * @return true if the team models have been updated
    */
   public boolean setTeamAccessPermissions(RepositoryModel repository, Collection<RegistrantAccessPermission> permissions) {
      List<TeamModel> teams = new ArrayList<TeamModel>();
      for (RegistrantAccessPermission tp : permissions) {
         if (tp.isEditable) {
            // only set explicitly defined access permissions
            TeamModel team = userService.getTeamModel(tp.registrant);
            team.setRepositoryPermission(repository.name, tp.permission);
            teams.add(team);
         }
      }
      return userService.updateTeamModels(teams);
   }
   /**
    * Returns the list of all teams who have an explicit access permission for
    * the specified repository.
    * 
    * @see IUserService.getTeamnamesForRepositoryRole(String)
    * @param repository
    * @return list of all teamnames that can bypass the access restriction
    * @return list of all teamnames with explicit access permissions to the repository
    */
   public List<String> getRepositoryTeams(RepositoryModel repository) {
      return userService.getTeamnamesForRepositoryRole(repository.name);
@@ -687,8 +885,11 @@
    * @param teamnames
    * @return true if successful
    */
   @Deprecated
   public boolean setRepositoryTeams(RepositoryModel repository, List<String> repositoryTeams) {
      return userService.setTeamnamesForRepositoryRole(repository.name, repositoryTeams);
      // rejects all changes since 1.2.0 because this would elevate
      // all discrete access permissions to RW+
      return false;
   }
   /**
@@ -722,15 +923,89 @@
   public boolean deleteTeam(String teamname) {
      return userService.deleteTeam(teamname);
   }
   /**
    * Adds the repository to the list of cached repositories if Gitblit is
    * configured to cache the repository list.
    *
    * @param model
    */
   private void addToCachedRepositoryList(RepositoryModel model) {
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList, true)) {
         repositoryListCache.put(model.name, model);
         // update the fork origin repository with this repository clone
         if (!StringUtils.isEmpty(model.originRepository)) {
            if (repositoryListCache.containsKey(model.originRepository)) {
               RepositoryModel origin = repositoryListCache.get(model.originRepository);
               origin.addFork(model.name);
            }
         }
      }
   }
   /**
    * Removes the repository from the list of cached repositories.
    *
    * @param name
    * @return the model being removed
    */
   private RepositoryModel removeFromCachedRepositoryList(String name) {
      if (StringUtils.isEmpty(name)) {
         return null;
      }
      return repositoryListCache.remove(name);
   }
   /**
    * Clears all the cached data for the specified repository.
    * Clears all the cached metadata for the specified repository.
    * 
    * @param repositoryName
    */
   public void clearRepositoryCache(String repositoryName) {
   private void clearRepositoryMetadataCache(String repositoryName) {
      repositorySizeCache.remove(repositoryName);
      repositoryMetricsCache.remove(repositoryName);
   }
   /**
    * Resets the repository list cache.
    *
    */
   public void resetRepositoryListCache() {
      logger.info("Repository cache manually reset");
      repositoryListCache.clear();
   }
   /**
    * Calculate the checksum of settings that affect the repository list cache.
    * @return a checksum
    */
   private String getRepositoryListSettingsChecksum() {
      StringBuilder ns = new StringBuilder();
      ns.append(settings.getString(Keys.git.cacheRepositoryList, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.onlyAccessBareRepositories, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.searchRepositoriesSubfolders, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.searchRecursionDepth, "")).append('\n');
      ns.append(settings.getString(Keys.git.searchExclusions, "")).append('\n');
      String checksum = StringUtils.getSHA1(ns.toString());
      return checksum;
   }
   /**
    * Compare the last repository list setting checksum to the current checksum.
    * If different then clear the cache so that it may be rebuilt.
    *
    * @return true if the cached repository list is valid since the last check
    */
   private boolean isValidRepositoryList() {
      String newChecksum = getRepositoryListSettingsChecksum();
      boolean valid = newChecksum.equals(repositoryListSettingsChecksum.get());
      repositoryListSettingsChecksum.set(newChecksum);
      if (!valid && settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
         logger.info("Repository list settings have changed. Clearing repository list cache.");
         repositoryListCache.clear();
      }
      return valid;
   }
   /**
@@ -740,10 +1015,48 @@
    * @return list of all repositories
    */
   public List<String> getRepositoryList() {
      return JGitUtils.getRepositoryList(repositoriesFolder,
            settings.getBoolean(Keys.git.onlyAccessBareRepositories, false),
            settings.getBoolean(Keys.git.searchRepositoriesSubfolders, true),
            settings.getInteger(Keys.git.searchRecursionDepth, -1));
      if (repositoryListCache.size() == 0 || !isValidRepositoryList()) {
         // we are not caching OR we have not yet cached OR the cached list is invalid
         long startTime = System.currentTimeMillis();
         List<String> repositories = JGitUtils.getRepositoryList(repositoriesFolder,
               settings.getBoolean(Keys.git.onlyAccessBareRepositories, false),
               settings.getBoolean(Keys.git.searchRepositoriesSubfolders, true),
               settings.getInteger(Keys.git.searchRecursionDepth, -1),
               settings.getStrings(Keys.git.searchExclusions));
         if (!settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
            // we are not caching
            StringUtils.sortRepositorynames(repositories);
            return repositories;
         } else {
            // we are caching this list
            String msg = "{0} repositories identified in {1} msecs";
            // optionally (re)calculate repository sizes
            if (getBoolean(Keys.web.showRepositorySizes, true)) {
               msg = "{0} repositories identified with calculated folder sizes in {1} msecs";
               for (String repository : repositories) {
                  RepositoryModel model = getRepositoryModel(repository);
                  if (!model.skipSizeCalculation) {
                     calculateSize(model);
                  }
               }
            } else {
               // update cache
               for (String repository : repositories) {
                  getRepositoryModel(repository);
               }
            }
            long duration = System.currentTimeMillis() - startTime;
            logger.info(MessageFormat.format(msg, repositoryListCache.size(), duration));
         }
      }
      // return sorted copy of cached list
      List<String> list = new ArrayList<String>(repositoryListCache.keySet());
      StringUtils.sortRepositorynames(list);
      return list;
   }
   /**
@@ -764,32 +1077,23 @@
    * @return repository or null
    */
   public Repository getRepository(String repositoryName, boolean logError) {
      if (isCollectingGarbage(repositoryName)) {
         logger.warn(MessageFormat.format("Rejecting request for {0}, busy collecting garbage!", repositoryName));
         return null;
      }
      File dir = FileKey.resolve(new File(repositoriesFolder, repositoryName), FS.DETECTED);
      if (dir == null)
         return null;
      Repository r = null;
      try {
         r = repositoryResolver.open(null, repositoryName);
      } catch (RepositoryNotFoundException e) {
         r = null;
         FileKey key = FileKey.exact(dir, FS.DETECTED);
         r = RepositoryCache.open(key, true);
      } catch (IOException e) {
         if (logError) {
            logger.error("GitBlit.getRepository(String) failed to find "
                  + new File(repositoriesFolder, repositoryName).getAbsolutePath());
         }
      } catch (ServiceNotAuthorizedException e) {
         r = null;
         if (logError) {
            logger.error("GitBlit.getRepository(String) failed to find "
                  + new File(repositoriesFolder, repositoryName).getAbsolutePath(), e);
         }
      } catch (ServiceNotEnabledException e) {
         r = null;
         if (logError) {
            logger.error("GitBlit.getRepository(String) failed to find "
                  + new File(repositoriesFolder, repositoryName).getAbsolutePath(), e);
         }
      } catch (ServiceMayNotContinueException e) {
         r = null;
         if (logError) {
            logger.error("GitBlit.getRepository(String) failed to find "
                  + new File(repositoriesFolder, repositoryName).getAbsolutePath(), e);
         }
      }
      return r;
@@ -802,6 +1106,7 @@
    * @return list of repository models accessible to user
    */
   public List<RepositoryModel> getRepositoryModels(UserModel user) {
      long methodStart = System.currentTimeMillis();
      List<String> list = getRepositoryList();
      List<RepositoryModel> repositories = new ArrayList<RepositoryModel>();
      for (String repo : list) {
@@ -821,9 +1126,15 @@
            }
         }
         long duration = System.currentTimeMillis() - startTime;
         logger.info(MessageFormat.format("{0} repository sizes calculated in {1} msecs",
         if (duration > 250) {
            // only log calcualtion time if > 250 msecs
            logger.info(MessageFormat.format("{0} repository sizes calculated in {1} msecs",
               repoCount, duration));
         }
      }
      long duration = System.currentTimeMillis() - methodStart;
      logger.info(MessageFormat.format("{0} repository models loaded for {1} in {2} msecs",
            repositories.size(), user == null ? "anonymous" : user.username, duration));
      return repositories;
   }
@@ -840,14 +1151,13 @@
      if (model == null) {
         return null;
      }
      if (model.accessRestriction.atLeast(AccessRestrictionType.VIEW)) {
         if (user != null && user.canAccessRepository(model)) {
            return model;
         }
         return null;
      } else {
      if (user == null) {
         user = UserModel.ANONYMOUS;
      }
      if (user.canView(model)) {
         return model;
      }
      return null;
   }
   /**
@@ -858,24 +1168,273 @@
    * @return repository model or null
    */
   public RepositoryModel getRepositoryModel(String repositoryName) {
      if (!repositoryListCache.containsKey(repositoryName)) {
         RepositoryModel model = loadRepositoryModel(repositoryName);
         if (model == null) {
            return null;
         }
         addToCachedRepositoryList(model);
         return model;
      }
      // cached model
      RepositoryModel model = repositoryListCache.get(repositoryName);
      if (gcExecutor.isCollectingGarbage(model.name)) {
         // Gitblit is busy collecting garbage, use our cached model
         RepositoryModel rm = DeepCopier.copy(model);
         rm.isCollectingGarbage = true;
         return rm;
      }
      // check for updates
      Repository r = getRepository(repositoryName);
      if (r == null) {
         // repository is missing
         removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
         logger.error(MessageFormat.format("Repository \"{0}\" is missing! Removing from cache.", repositoryName));
         return null;
      }
      FileBasedConfig config = (FileBasedConfig) getRepositoryConfig(r);
      if (config.isOutdated()) {
         // reload model
         logger.info(MessageFormat.format("Config for \"{0}\" has changed. Reloading model and updating cache.", repositoryName));
         model = loadRepositoryModel(repositoryName);
         removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
         addToCachedRepositoryList(model);
      } else {
         // update a few repository parameters
         if (!model.hasCommits) {
            // update hasCommits, assume a repository only gains commits :)
            model.hasCommits = JGitUtils.hasCommits(r);
         }
         model.lastChange = JGitUtils.getLastChange(r);
      }
      r.close();
      // return a copy of the cached model
      return DeepCopier.copy(model);
   }
   /**
    * Returns the map of project config.  This map is cached and reloaded if
    * the underlying projects.conf file changes.
    *
    * @return project config map
    */
   private Map<String, ProjectModel> getProjectConfigs() {
      if (projectCache.isEmpty() || projectConfigs.isOutdated()) {
         try {
            projectConfigs.load();
         } catch (Exception e) {
         }
         // project configs
         String rootName = GitBlit.getString(Keys.web.repositoryRootGroupName, "main");
         ProjectModel rootProject = new ProjectModel(rootName, true);
         Map<String, ProjectModel> configs = new HashMap<String, ProjectModel>();
         // cache the root project under its alias and an empty path
         configs.put("", rootProject);
         configs.put(rootProject.name.toLowerCase(), rootProject);
         for (String name : projectConfigs.getSubsections("project")) {
            ProjectModel project;
            if (name.equalsIgnoreCase(rootName)) {
               project = rootProject;
            } else {
               project = new ProjectModel(name);
            }
            project.title = projectConfigs.getString("project", name, "title");
            project.description = projectConfigs.getString("project", name, "description");
            configs.put(name.toLowerCase(), project);
         }
         projectCache.clear();
         projectCache.putAll(configs);
      }
      return projectCache;
   }
   /**
    * Returns a list of project models for the user.
    *
    * @param user
    * @param includeUsers
    * @return list of projects that are accessible to the user
    */
   public List<ProjectModel> getProjectModels(UserModel user, boolean includeUsers) {
      Map<String, ProjectModel> configs = getProjectConfigs();
      // per-user project lists, this accounts for security and visibility
      Map<String, ProjectModel> map = new TreeMap<String, ProjectModel>();
      // root project
      map.put("", configs.get(""));
      for (RepositoryModel model : getRepositoryModels(user)) {
         String rootPath = StringUtils.getRootPath(model.name).toLowerCase();
         if (!map.containsKey(rootPath)) {
            ProjectModel project;
            if (configs.containsKey(rootPath)) {
               // clone the project model because it's repository list will
               // be tailored for the requesting user
               project = DeepCopier.copy(configs.get(rootPath));
            } else {
               project = new ProjectModel(rootPath);
            }
            map.put(rootPath, project);
         }
         map.get(rootPath).addRepository(model);
      }
      // sort projects, root project first
      List<ProjectModel> projects;
      if (includeUsers) {
         // all projects
         projects = new ArrayList<ProjectModel>(map.values());
         Collections.sort(projects);
         projects.remove(map.get(""));
         projects.add(0, map.get(""));
      } else {
         // all non-user projects
         projects = new ArrayList<ProjectModel>();
         ProjectModel root = map.remove("");
         for (ProjectModel model : map.values()) {
            if (!model.isUserProject()) {
               projects.add(model);
            }
         }
         Collections.sort(projects);
         projects.add(0, root);
      }
      return projects;
   }
   /**
    * Returns the project model for the specified user.
    *
    * @param name
    * @param user
    * @return a project model, or null if it does not exist
    */
   public ProjectModel getProjectModel(String name, UserModel user) {
      for (ProjectModel project : getProjectModels(user, true)) {
         if (project.name.equalsIgnoreCase(name)) {
            return project;
         }
      }
      return null;
   }
   /**
    * Returns a project model for the Gitblit/system user.
    *
    * @param name a project name
    * @return a project model or null if the project does not exist
    */
   public ProjectModel getProjectModel(String name) {
      Map<String, ProjectModel> configs = getProjectConfigs();
      ProjectModel project = configs.get(name.toLowerCase());
      if (project == null) {
         project = new ProjectModel(name);
         if (name.length() > 0 && name.charAt(0) == '~') {
            UserModel user = getUserModel(name.substring(1));
            if (user != null) {
               project.title = user.getDisplayName();
               project.description = "personal repositories";
            }
         }
      } else {
         // clone the object
         project = DeepCopier.copy(project);
      }
      if (StringUtils.isEmpty(name)) {
         // get root repositories
         for (String repository : getRepositoryList()) {
            if (repository.indexOf('/') == -1) {
               project.addRepository(repository);
            }
         }
      } else {
         // get repositories in subfolder
         String folder = name.toLowerCase() + "/";
         for (String repository : getRepositoryList()) {
            if (repository.toLowerCase().startsWith(folder)) {
               project.addRepository(repository);
            }
         }
      }
      if (project.repositories.size() == 0) {
         // no repositories == no project
         return null;
      }
      return project;
   }
   /**
    * Workaround JGit.  I need to access the raw config object directly in order
    * to see if the config is dirty so that I can reload a repository model.
    * If I use the stock JGit method to get the config it already reloads the
    * config.  If the config changes are made within Gitblit this is fine as
    * the returned config will still be flagged as dirty.  BUT... if the config
    * is manipulated outside Gitblit then it fails to recognize this as dirty.
    *
    * @param r
    * @return a config
    */
   private StoredConfig getRepositoryConfig(Repository r) {
      try {
         Field f = r.getClass().getDeclaredField("repoConfig");
         f.setAccessible(true);
         StoredConfig config = (StoredConfig) f.get(r);
         return config;
      } catch (Exception e) {
         logger.error("Failed to retrieve \"repoConfig\" via reflection", e);
      }
      return r.getConfig();
   }
   /**
    * Create a repository model from the configuration and repository data.
    *
    * @param repositoryName
    * @return a repositoryModel or null if the repository does not exist
    */
   private RepositoryModel loadRepositoryModel(String repositoryName) {
      Repository r = getRepository(repositoryName);
      if (r == null) {
         return null;
      }
      RepositoryModel model = new RepositoryModel();
      model.name = repositoryName;
      model.isBare = r.isBare();
      File basePath = getFileOrFolder(Keys.git.repositoriesFolder, "git");
      if (model.isBare) {
         model.name = com.gitblit.utils.FileUtils.getRelativePath(basePath, r.getDirectory());
      } else {
         model.name = com.gitblit.utils.FileUtils.getRelativePath(basePath, r.getDirectory().getParentFile());
      }
      model.hasCommits = JGitUtils.hasCommits(r);
      model.lastChange = JGitUtils.getLastChange(r);
      model.isBare = r.isBare();
      StoredConfig config = JGitUtils.readConfig(r);
      model.projectPath = StringUtils.getFirstPathElement(repositoryName);
      StoredConfig config = r.getConfig();
      boolean hasOrigin = !StringUtils.isEmpty(config.getString("remote", "origin", "url"));
      if (config != null) {
         model.description = getConfig(config, "description", "");
         model.owner = getConfig(config, "owner", "");
         model.useTickets = getConfig(config, "useTickets", false);
         model.useDocs = getConfig(config, "useDocs", false);
         model.allowForks = getConfig(config, "allowForks", true);
         model.accessRestriction = AccessRestrictionType.fromName(getConfig(config,
               "accessRestriction", settings.getString(Keys.git.defaultAccessRestriction, null)));
         model.showRemoteBranches = getConfig(config, "showRemoteBranches", false);
         model.authorizationControl = AuthorizationControl.fromName(getConfig(config,
               "authorizationControl", settings.getString(Keys.git.defaultAuthorizationControl, null)));
         model.verifyCommitter = getConfig(config, "verifyCommitter", false);
         model.showRemoteBranches = getConfig(config, "showRemoteBranches", hasOrigin);
         model.isFrozen = getConfig(config, "isFrozen", false);
         model.showReadme = getConfig(config, "showReadme", false);
         model.skipSizeCalculation = getConfig(config, "skipSizeCalculation", false);
@@ -885,7 +1444,17 @@
         model.federationSets = new ArrayList<String>(Arrays.asList(config.getStringList(
               Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "federationSets")));
         model.isFederated = getConfig(config, "isFederated", false);
         model.gcThreshold = getConfig(config, "gcThreshold", settings.getString(Keys.git.defaultGarbageCollectionThreshold, "500KB"));
         model.gcPeriod = getConfig(config, "gcPeriod", settings.getInteger(Keys.git.defaultGarbageCollectionPeriod, 7));
         try {
            model.lastGC = new SimpleDateFormat(Constants.ISO8601).parse(getConfig(config, "lastGC", "1970-01-01'T'00:00:00Z"));
         } catch (Exception e) {
            model.lastGC = new Date(0);
         }
         model.origin = config.getString("remote", "origin", "url");
         if (model.origin != null) {
            model.origin = model.origin.replace('\\', '/');
         }
         model.preReceiveScripts = new ArrayList<String>(Arrays.asList(config.getStringList(
               Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "preReceiveScript")));
         model.postReceiveScripts = new ArrayList<String>(Arrays.asList(config.getStringList(
@@ -904,7 +1473,151 @@
      model.HEAD = JGitUtils.getHEADRef(r);
      model.availableRefs = JGitUtils.getAvailableHeadTargets(r);
      r.close();
      if (model.origin != null && model.origin.startsWith("file://")) {
         // repository was cloned locally... perhaps as a fork
         try {
            File folder = new File(new URI(model.origin));
            String originRepo = com.gitblit.utils.FileUtils.getRelativePath(getRepositoriesFolder(), folder);
            if (!StringUtils.isEmpty(originRepo)) {
               // ensure origin still exists
               File repoFolder = new File(getRepositoriesFolder(), originRepo);
               if (repoFolder.exists()) {
                  model.originRepository = originRepo;
               }
            }
         } catch (URISyntaxException e) {
            logger.error("Failed to determine fork for " + model, e);
         }
      }
      return model;
   }
   /**
    * Determines if this server has the requested repository.
    *
    * @param name
    * @return true if the repository exists
    */
   public boolean hasRepository(String repositoryName) {
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList, true)) {
         // if we are caching use the cache to determine availability
         // otherwise we end up adding a phantom repository to the cache
         return repositoryListCache.containsKey(repositoryName);
      }
      Repository r = getRepository(repositoryName, false);
      if (r == null) {
         return false;
      }
      r.close();
      return true;
   }
   /**
    * Determines if the specified user has a fork of the specified origin
    * repository.
    *
    * @param username
    * @param origin
    * @return true the if the user has a fork
    */
   public boolean hasFork(String username, String origin) {
      return getFork(username, origin) != null;
   }
   /**
    * Gets the name of a user's fork of the specified origin
    * repository.
    *
    * @param username
    * @param origin
    * @return the name of the user's fork, null otherwise
    */
   public String getFork(String username, String origin) {
      String userProject = "~" + username.toLowerCase();
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList, true)) {
         String userPath = userProject + "/";
         // collect all origin nodes in fork network
         Set<String> roots = new HashSet<String>();
         roots.add(origin);
         RepositoryModel originModel = repositoryListCache.get(origin);
         while (originModel != null) {
            if (!ArrayUtils.isEmpty(originModel.forks)) {
               for (String fork : originModel.forks) {
                  if (!fork.startsWith(userPath)) {
                     roots.add(fork);
                  }
               }
            }
            if (originModel.originRepository != null) {
               roots.add(originModel.originRepository);
               originModel = repositoryListCache.get(originModel.originRepository);
            } else {
               // break
               originModel = null;
            }
         }
         for (String repository : repositoryListCache.keySet()) {
            if (repository.toLowerCase().startsWith(userPath)) {
               RepositoryModel model = repositoryListCache.get(repository);
               if (!StringUtils.isEmpty(model.originRepository)) {
                  if (roots.contains(model.originRepository)) {
                     // user has a fork in this graph
                     return model.name;
                  }
               }
            }
         }
      } else {
         // not caching
         ProjectModel project = getProjectModel(userProject);
         for (String repository : project.repositories) {
            if (repository.toLowerCase().startsWith(userProject)) {
               RepositoryModel model = repositoryListCache.get(repository);
               if (model.originRepository.equalsIgnoreCase(origin)) {
                  // user has a fork
                  return model.name;
               }
            }
         }
      }
      // user does not have a fork
      return null;
   }
   /**
    * Returns the fork network for a repository by traversing up the fork graph
    * to discover the root and then down through all children of the root node.
    *
    * @param repository
    * @return a ForkModel
    */
   public ForkModel getForkNetwork(String repository) {
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList, true)) {
         // find the root
         RepositoryModel model = repositoryListCache.get(repository);
         while (model.originRepository != null) {
            model = repositoryListCache.get(model.originRepository);
         }
         ForkModel root = getForkModel(model.name);
         return root;
      }
      return null;
   }
   private ForkModel getForkModel(String repository) {
      RepositoryModel model = repositoryListCache.get(repository);
      ForkModel fork = new ForkModel(model);
      if (!ArrayUtils.isEmpty(model.forks)) {
         for (String aFork : model.forks) {
            ForkModel fm = getForkModel(aFork);
            fork.forks.add(fm);
         }
      }
      return fork;
   }
   /**
@@ -934,6 +1647,11 @@
    */
   private void closeRepository(String repositoryName) {
      Repository repository = getRepository(repositoryName);
      if (repository == null) {
         return;
      }
      RepositoryCache.close(repository);
      // assume 2 uses in case reflection fails
      int uses = 2;
      try {
@@ -1012,6 +1730,27 @@
   private boolean getConfig(StoredConfig config, String field, boolean defaultValue) {
      return config.getBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, field, defaultValue);
   }
   /**
    * Returns the gitblit string value for the specified key. If key is not
    * set, returns defaultValue.
    *
    * @param config
    * @param field
    * @param defaultValue
    * @return field value or defaultValue
    */
   private int getConfig(StoredConfig config, String field, int defaultValue) {
      String value = config.getString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, field);
      if (StringUtils.isEmpty(value)) {
         return defaultValue;
      }
      try {
         return Integer.parseInt(value);
      } catch (Exception e) {
      }
      return defaultValue;
   }
   /**
    * Creates/updates the repository model keyed by reopsitoryName. Saves all
@@ -1029,7 +1768,18 @@
    */
   public void updateRepositoryModel(String repositoryName, RepositoryModel repository,
         boolean isCreate) throws GitBlitException {
      if (gcExecutor.isCollectingGarbage(repositoryName)) {
         throw new GitBlitException(MessageFormat.format("sorry, Gitblit is busy collecting garbage in {0}",
               repositoryName));
      }
      Repository r = null;
      String projectPath = StringUtils.getFirstPathElement(repository.name);
      if (!StringUtils.isEmpty(projectPath)) {
         if (projectPath.equalsIgnoreCase(getString(Keys.web.repositoryRootGroupName, "main"))) {
            // strip leading group name
            repository.name = repository.name.substring(projectPath.length() + 1);
         }
      }
      if (isCreate) {
         // ensure created repository name ends with .git
         if (!repository.name.toLowerCase().endsWith(org.eclipse.jgit.lib.Constants.DOT_GIT_EXT)) {
@@ -1080,24 +1830,40 @@
                     "Failed to rename repository permissions ''{0}'' to ''{1}''.",
                     repositoryName, repository.name));
            }
            // rename fork origins in their configs
            if (!ArrayUtils.isEmpty(repository.forks)) {
               for (String fork : repository.forks) {
                  Repository rf = getRepository(fork);
                  try {
                     StoredConfig config = rf.getConfig();
                     String origin = config.getString("remote", "origin", "url");
                     origin = origin.replace(repositoryName, repository.name);
                     config.setString("remote", "origin", "url", origin);
                     config.save();
                  } catch (Exception e) {
                     logger.error("Failed to update repository fork config for " + fork, e);
                  }
                  rf.close();
               }
            }
            // remove this repository from any origin model's fork list
            if (!StringUtils.isEmpty(repository.originRepository)) {
               RepositoryModel origin = repositoryListCache.get(repository.originRepository);
               if (origin != null && !ArrayUtils.isEmpty(origin.forks)) {
                  origin.forks.remove(repositoryName);
               }
            }
            // clear the cache
            clearRepositoryCache(repositoryName);
            clearRepositoryMetadataCache(repositoryName);
            repository.resetDisplayName();
         }
         // load repository
         logger.info("edit repository " + repository.name);
         try {
            r = repositoryResolver.open(null, repository.name);
         } catch (RepositoryNotFoundException e) {
            logger.error("Repository not found", e);
         } catch (ServiceNotAuthorizedException e) {
            logger.error("Service not authorized", e);
         } catch (ServiceNotEnabledException e) {
            logger.error("Service not enabled", e);
         } catch (ServiceMayNotContinueException e) {
            logger.error("Service may not continue", e);
         }
         r = getRepository(repository.name);
      }
      // update settings
@@ -1110,15 +1876,20 @@
                  repository.name, currentRef, repository.HEAD));
            if (JGitUtils.setHEADtoRef(r, repository.HEAD)) {
               // clear the cache
               clearRepositoryCache(repository.name);
               clearRepositoryMetadataCache(repository.name);
            }
         }
         // close the repository object
         r.close();
      }
      // update repository cache
      removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
      // model will actually be replaced on next load because config is stale
      addToCachedRepositoryList(repository);
   }
   /**
    * Updates the Gitblit configuration for the specified repository.
    * 
@@ -1128,12 +1899,15 @@
    *            the Gitblit repository model
    */
   public void updateConfiguration(Repository r, RepositoryModel repository) {
      StoredConfig config = JGitUtils.readConfig(r);
      StoredConfig config = r.getConfig();
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "description", repository.description);
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "owner", repository.owner);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "useTickets", repository.useTickets);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "useDocs", repository.useDocs);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "allowForks", repository.allowForks);
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "accessRestriction", repository.accessRestriction.name());
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "authorizationControl", repository.authorizationControl.name());
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "verifyCommitter", repository.verifyCommitter);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "showRemoteBranches", repository.showRemoteBranches);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "isFrozen", repository.isFrozen);
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "showReadme", repository.showReadme);
@@ -1142,6 +1916,11 @@
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "federationStrategy",
            repository.federationStrategy.name());
      config.setBoolean(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "isFederated", repository.isFederated);
      config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "gcThreshold", repository.gcThreshold);
      config.setInt(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "gcPeriod", repository.gcPeriod);
      if (repository.lastGC != null) {
         config.setString(Constants.CONFIG_GITBLIT, null, "lastGC", new SimpleDateFormat(Constants.ISO8601).format(repository.lastGC));
      }
      updateList(config, "federationSets", repository.federationSets);
      updateList(config, "preReceiveScript", repository.preReceiveScripts);
@@ -1205,16 +1984,22 @@
   public boolean deleteRepository(String repositoryName) {
      try {
         closeRepository(repositoryName);
         // clear the repository cache
         clearRepositoryMetadataCache(repositoryName);
         RepositoryModel model = removeFromCachedRepositoryList(repositoryName);
         if (model != null && !ArrayUtils.isEmpty(model.forks)) {
            resetRepositoryListCache();
         }
         File folder = new File(repositoriesFolder, repositoryName);
         if (folder.exists() && folder.isDirectory()) {
            FileUtils.delete(folder, FileUtils.RECURSIVE | FileUtils.RETRY);
            if (userService.deleteRepositoryRole(repositoryName)) {
               logger.info(MessageFormat.format("Repository \"{0}\" deleted", repositoryName));
               return true;
            }
         }
         // clear the repository cache
         clearRepositoryCache(repositoryName);
      } catch (Throwable t) {
         logger.error(MessageFormat.format("Failed to delete repository {0}", repositoryName), t);
      }
@@ -1855,10 +2640,11 @@
    * Parse the properties file and aggregate all the comments by the setting
    * key. A setting model tracks the current value, the default value, the
    * description of the setting and and directives about the setting.
    * @param referencePropertiesInputStream
    * 
    * @return Map<String, SettingModel>
    */
   private ServerSettings loadSettingModels() {
   private ServerSettings loadSettingModels(InputStream referencePropertiesInputStream) {
      ServerSettings settingsModel = new ServerSettings();
      settingsModel.supportsCredentialChanges = userService.supportsCredentialChanges();
      settingsModel.supportsDisplayNameChanges = userService.supportsDisplayNameChanges();
@@ -1868,7 +2654,7 @@
         // Read bundled Gitblit properties to extract setting descriptions.
         // This copy is pristine and only used for populating the setting
         // models map.
         InputStream is = servletContext.getResourceAsStream("/WEB-INF/reference.properties");
         InputStream is = referencePropertiesInputStream;
         BufferedReader propertiesReader = new BufferedReader(new InputStreamReader(is));
         StringBuilder description = new StringBuilder();
         SettingModel setting = new SettingModel();
@@ -1930,34 +2716,82 @@
   public void configureContext(IStoredSettings settings, boolean startFederation) {
      logger.info("Reading configuration from " + settings.toString());
      this.settings = settings;
      // prepare service executors
      mailExecutor = new MailExecutor(settings);
      luceneExecutor = new LuceneExecutor(settings, repositoriesFolder);
      gcExecutor = new GCExecutor(settings);
      repositoriesFolder = getRepositoriesFolder();
      logger.info("Git repositories folder " + repositoriesFolder.getAbsolutePath());
      repositoryResolver = new FileResolver<Void>(repositoriesFolder, true);
      // calculate repository list settings checksum for future config changes
      repositoryListSettingsChecksum.set(getRepositoryListSettingsChecksum());
      // build initial repository list
      if (settings.getBoolean(Keys.git.cacheRepositoryList,  true)) {
         logger.info("Identifying available repositories...");
         getRepositoryList();
      }
      
      logTimezone("JVM", TimeZone.getDefault());
      logTimezone(Constants.NAME, getTimezone());
      serverStatus = new ServerStatus(isGO());
      String realm = settings.getString(Keys.realm.userService, "users.properties");
      IUserService loginService = null;
      try {
         // check to see if this "file" is a login service class
         Class<?> realmClass = Class.forName(realm);
         loginService = (IUserService) realmClass.newInstance();
      } catch (Throwable t) {
         loginService = new GitblitUserService();
      if (this.userService == null) {
         String realm = settings.getString(Keys.realm.userService, "users.properties");
         IUserService loginService = null;
         try {
            // check to see if this "file" is a login service class
            Class<?> realmClass = Class.forName(realm);
            loginService = (IUserService) realmClass.newInstance();
         } catch (Throwable t) {
            loginService = new GitblitUserService();
         }
         setUserService(loginService);
      }
      setUserService(loginService);
      mailExecutor = new MailExecutor(settings);
      // load and cache the project metadata
      projectConfigs = new FileBasedConfig(getFileOrFolder(Keys.web.projectsFile, "projects.conf"), FS.detect());
      getProjectConfigs();
      // schedule mail engine
      if (mailExecutor.isReady()) {
         logger.info("Mail executor is scheduled to process the message queue every 2 minutes.");
         scheduledExecutor.scheduleAtFixedRate(mailExecutor, 1, 2, TimeUnit.MINUTES);
      } else {
         logger.warn("Mail server is not properly configured.  Mail services disabled.");
      }
      luceneExecutor = new LuceneExecutor(settings, repositoriesFolder);
      // schedule lucene engine
      logger.info("Lucene executor is scheduled to process indexed branches every 2 minutes.");
      scheduledExecutor.scheduleAtFixedRate(luceneExecutor, 1, 2, TimeUnit.MINUTES);
      // schedule gc engine
      if (gcExecutor.isReady()) {
         logger.info("GC executor is scheduled to scan repositories every 24 hours.");
         Calendar c = Calendar.getInstance();
         c.set(Calendar.HOUR_OF_DAY, settings.getInteger(Keys.git.garbageCollectionHour, 0));
         c.set(Calendar.MINUTE, 0);
         c.set(Calendar.SECOND, 0);
         c.set(Calendar.MILLISECOND, 0);
         Date cd = c.getTime();
         Date now = new Date();
         int delay = 0;
         if (cd.before(now)) {
            c.add(Calendar.DATE, 1);
            cd = c.getTime();
         }
         delay = (int) ((cd.getTime() - now.getTime())/TimeUtils.MIN);
         String when = delay + " mins";
         if (delay > 60) {
            when = MessageFormat.format("{0,number,0.0} hours", ((float)delay)/60f);
         }
         logger.info(MessageFormat.format("Next scheculed GC scan is in {0}", when));
         scheduledExecutor.scheduleAtFixedRate(gcExecutor, delay, 60*24, TimeUnit.MINUTES);
      }
      if (startFederation) {
         configureFederation();
      }
@@ -1983,6 +2817,8 @@
      } catch (IllegalArgumentException e) {
         logger.error("Failed to configure JGit parameters!", e);
      }
      ContainerUtils.CVE_2007_0450.test();
   }
   
   private void logTimezone(String type, TimeZone zone) {
@@ -2000,6 +2836,10 @@
    */
   @Override
   public void contextInitialized(ServletContextEvent contextEvent) {
      contextInitialized(contextEvent, contextEvent.getServletContext().getResourceAsStream("/WEB-INF/reference.properties"));
   }
   public void contextInitialized(ServletContextEvent contextEvent, InputStream referencePropertiesInputStream) {
      servletContext = contextEvent.getServletContext();
      if (settings == null) {
         // Gitblit WAR is running in a servlet container
@@ -2040,7 +2880,7 @@
         }
      }
      
      settingsModel = loadSettingModels();
      settingsModel = loadSettingModels(referencePropertiesInputStream);
      serverStatus.servletContainer = servletContext.getServerInfo();
   }
@@ -2053,5 +2893,95 @@
      logger.info("Gitblit context destroyed by servlet container.");
      scheduledExecutor.shutdownNow();
      luceneExecutor.close();
      gcExecutor.close();
   }
   /**
    * Returns true if Gitblit is actively collecting garbage in this repository.
    *
    * @param repositoryName
    * @return true if actively collecting garbage
    */
   public boolean isCollectingGarbage(String repositoryName) {
      return gcExecutor.isCollectingGarbage(repositoryName);
   }
   /**
    * Creates a personal fork of the specified repository. The clone is view
    * restricted by default and the owner of the source repository is given
    * access to the clone.
    *
    * @param repository
    * @param user
    * @return the repository model of the fork, if successful
    * @throws GitBlitException
    */
   public RepositoryModel fork(RepositoryModel repository, UserModel user) throws GitBlitException {
      String cloneName = MessageFormat.format("~{0}/{1}.git", user.username, StringUtils.stripDotGit(StringUtils.getLastPathElement(repository.name)));
      String fromUrl = MessageFormat.format("file://{0}/{1}", repositoriesFolder.getAbsolutePath(), repository.name);
      // clone the repository
      try {
         JGitUtils.cloneRepository(repositoriesFolder, cloneName, fromUrl, true, null);
      } catch (Exception e) {
         throw new GitBlitException(e);
      }
      // create a Gitblit repository model for the clone
      RepositoryModel cloneModel = repository.cloneAs(cloneName);
      // owner has REWIND/RW+ permissions
      cloneModel.owner = user.username;
      updateRepositoryModel(cloneName, cloneModel, false);
      // add the owner of the source repository to the clone's access list
      if (!StringUtils.isEmpty(repository.owner)) {
         UserModel originOwner = getUserModel(repository.owner);
         if (originOwner != null) {
            originOwner.setRepositoryPermission(cloneName, AccessPermission.CLONE);
            updateUserModel(originOwner.username, originOwner, false);
         }
      }
      // grant origin's user list clone permission to fork
      List<String> users = getRepositoryUsers(repository);
      List<UserModel> cloneUsers = new ArrayList<UserModel>();
      for (String name : users) {
         if (!name.equalsIgnoreCase(user.username)) {
            UserModel cloneUser = getUserModel(name);
            if (cloneUser.canClone(repository)) {
               // origin user can clone origin, grant clone access to fork
               cloneUser.setRepositoryPermission(cloneName, AccessPermission.CLONE);
            }
            cloneUsers.add(cloneUser);
         }
      }
      userService.updateUserModels(cloneUsers);
      // grant origin's team list clone permission to fork
      List<String> teams = getRepositoryTeams(repository);
      List<TeamModel> cloneTeams = new ArrayList<TeamModel>();
      for (String name : teams) {
         TeamModel cloneTeam = getTeamModel(name);
         if (cloneTeam.canClone(repository)) {
            // origin team can clone origin, grant clone access to fork
            cloneTeam.setRepositoryPermission(cloneName, AccessPermission.CLONE);
         }
         cloneTeams.add(cloneTeam);
      }
      userService.updateTeamModels(cloneTeams);
      // add this clone to the cached model
      addToCachedRepositoryList(cloneModel);
      return cloneModel;
   }
   /**
    * Allow to understand if GitBlit supports and is configured to allow
    * cookie-based authentication.
    *
    * @return status of Cookie authentication enablement.
    */
   public boolean allowCookieAuthentication() {
      return GitBlit.getBoolean(Keys.web.allowCookieAuthentication, true) && userService.supportsCookies();
   }
}